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普通PCR简述

Brief introduction of ordinary PCR

1、发展简史

20世纪60年代末70年代初 ,人们致力于研究基因的体外分离技术。Khorana于1971年最早提出核酸体外扩增的设想。但是 ,当时的基因序列分析方法尚未成熟 ,对热具有较强稳定性的DNA聚合酶还未发现。1985年 ,美国科学家Kary Mullis发明了PCR技术 ,并在Science杂志上发表了关于PCR技术的第一篇学术论文。从此 ,PCR技术得到了生命科学界的普遍认同 ,Kary Mullis也因此而获得1993年的诺贝尔化学奖。1988年初 ,Keohanog通过对所使用的酶的改进 ,提高了扩增的真实性。尔后 ,Saiki等人又从生活在温泉中的水生嗜热杆菌内提取到一种耐热的DNA聚合酶 ,使得PCR技术的扩增效率大大提高。

2、技术原理

DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解链成单链 ,在DNA聚合酶与启动子的参与下 ,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子挎贝。

在聚合酶链式反应实验中发现 ,DNA在高温时也可以发生变性解链 ,当温度降低后又可以复性成为双链。因此 ,通过温度变化控制DNA的变性和复性 ,并设计引物做启动子 ,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。( DNA高温变性低温复性)

发现耐热DNA聚合同酶#Taq酶对于PCR的应用有里程碑的意义 ,该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活 ,不需要每个循环加酶 ,使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本 ,PCR技术得以大量应用 ,并逐步应用于临床。

3、普通PCR反应流程

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4、反应原理

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5、PCR循环

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6、与荧光定量PCR技术相比较主要缺点

1、常规PCR结合电泳分析方法的缺点

2、只能对终产物进行分析 ,无法对起始模版准确定量

3、必须在扩增反映结束后借助电泳方法分析 ,费时费事

4、无法对扩增反应实时检测

5、EB有毒

荧光PCR简述

1、发展简史

定义:在PCR反应体系中加入荧光基团 ,利用荧光信号的变化 ,通过仪器软件实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化 ,通过Ct值和标准曲线实现对起始模板的定量分析。

2、荧光PCR检测分为两种方法:

荧光探针法和荧光染料法。

3、荧光探针法检测原理:

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4、荧光PCR如何实现实时监控的呢 ?

→ PCR反应体系中加入荧光染料

→ 所有的定量PCR仪器都有三个共同的组成部分(检测器、激发光源、热循环 ?椋

→ 在扩增过程中 ,荧光信号随着PCR产物的增加而增强

→ 每个循环结束后 ,定量PCR仪器通过光学系统记录荧光信号的增加

→ PCR软件计算出数据 ,用于实验结果的分析

→ 苏州9888拉斯维加斯官网产品技术平台:ARMS检测方法;1个SNP位点设计双管反应 ,含目的基因检测及内参检测双通道。

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5、技术特点:

→准确可靠 ,临床双盲对照试验>1000例 ,结果与金标准测序法比对 ,结果一致性大于99%。

→ 高灵敏:可检测低至10ng的人基因组DNA。

→快速:整个检测流程只需3小时。

→简便:试剂盒提供预混好的试剂 ,使体系配置操作简便。

→防污染

→高特异性:双重特异性组成 ,保证检测结果的特异性和准确性引物与DNA互补链结合必需完全配对 ,才能延伸。探针特异性与所检测基因的PCR产物配对 ,在延伸中产生荧光。

6、临床基因检测技术比较:

方法

原理

适用

优点

弱点

操作

准确性

市场应用

DNA芯片

PCR-芯片杂交

多位点

多基因 ,多为点同时

少数位点

步骤多 ,易污染

较高

临床使用

PCR-RFLP

PCR-酶切-电泳

SNP位点

多位点

步骤多 ,易污染

较高

逐步淘汰

Sanger测序

PCR-测序

SNP位点 ,缺失突变

 

时间长

步骤多

金标准

无注册证

PCR-荧光染料法

荧光PCR

单个基因

快速 ,简便

假阳性

简单一步

核酸检测

PCR-荧光探针法

Taqman

SNP ,多态性

快速 ,简便

少数位点

简单一步

普及

液相芯片法

PCR-液相杂交

SNP, 多基因 ,多位点

 

易污染

步骤多

较高

非主流

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